La devoción a san Fernando III es especialmente fuerte en Sevilla, donde se guarda su cuerpo incorrupto en la catedral, junto a la Capilla Real, y donde cada 30 de mayo se celebra su memoria con actos litúrgicos y cívicos. También se le venera en Burgos, Córdoba y León, ciudades ligadas a su reinado y a la expansión del cristianismo en la península. Su culto está muy unido a la identidad histórica de la monarquía española y a la idea del rey santo como protector del reino. Es patrono de Sevilla, de la ingeniería militar y de la ciudad de San Fernando en Cádiz, cuyo nombre recuerda su prestigio histórico. En muchas iglesias españolas se le representa con corona, espada y cruz, símbolos de su doble condición de soberano y creyente. Su festividad se celebra sobre todo el 30 de mayo, aunque en la ciudad de Sevilla su memoria tiene resonancia especial en el calendario local y en la religiosidad popular.